Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ATG16L1Q676U5 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ATG16L1Q676U5 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms