Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC006120.1-201ENST00000579375 546 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 C17orf80-208ENST00000582793 531 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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