Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TRIM35Q9UPQ4 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TRIM35Q9UPQ4 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
TRIM35Q9UPQ4 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
TRIM35Q9UPQ4 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TRIM35Q9UPQ4 ZNF10-202ENST00000402932 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TRIM35Q9UPQ4 HEATR9-207ENST00000604834 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TRIM35Q9UPQ4 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
TRIM35Q9UPQ4 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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TRIM35Q9UPQ4 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
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TRIM35Q9UPQ4 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
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TRIM35Q9UPQ4 TRIM66-201ENST00000299550 9753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TRIM35Q9UPQ4 UBR1-202ENST00000546274 3332 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TRIM35Q9UPQ4 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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TRIM35Q9UPQ4 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TRIM35Q9UPQ4 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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TRIM35Q9UPQ4 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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TRIM35Q9UPQ4 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
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