Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms