Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 RPL29P7-201ENST00000440227 457 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AC079594.1-201ENST00000489757 331 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AP001646.2-201ENST00000528645 1156 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PMS2P11Q13670 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PMS2P11Q13670 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PMS2P11Q13670 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PMS2P11Q13670 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PMS2P11Q13670 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PMS2P11Q13670 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms