Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ACTBP60709 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ACTBP60709 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms