Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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ECM1Q16610 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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ECM1Q16610 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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ECM1Q16610 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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ECM1Q16610 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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ECM1Q16610 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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ECM1Q16610 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ECM1Q16610 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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