Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
R3HDM1Q15032 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms