Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
DUSP4Q13115 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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