Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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FOXD4Q12950 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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FOXD4Q12950 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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FOXD4Q12950 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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FOXD4Q12950 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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FOXD4Q12950 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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FOXD4Q12950 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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FOXD4Q12950 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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FOXD4Q12950 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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FOXD4Q12950 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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