Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAPPC9Q96Q05 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC9Q96Q05 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms