Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1BQ13112 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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