Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASP1P29466 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CASP1P29466 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CASP1P29466 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASP1P29466 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASP1P29466 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASP1P29466 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASP1P29466 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CASP1P29466 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CASP1P29466 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CASP1P29466 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CASP1P29466 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASP1P29466 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASP1P29466 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASP1P29466 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASP1P29466 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASP1P29466 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASP1P29466 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASP1P29466 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASP1P29466 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CASP1P29466 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASP1P29466 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASP1P29466 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASP1P29466 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CASP1P29466 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASP1P29466 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CASP1P29466 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CASP1P29466 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CASP1P29466 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CASP1P29466 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms