Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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PTPRFP10586 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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PTPRFP10586 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRFP10586 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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