Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 PRPS1P2-201ENST00000430496 937 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL606752.1-201ENST00000435442 666 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 TRMT2B-AS1-201ENST00000443801 205 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00460-203ENST00000444865 739 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 PTMAP1-205ENST00000455552 325 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 ABRACL-202ENST00000461027 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 ALG13-214ENST00000482742 620 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC127024.1-201ENST00000490847 418 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL416P-201ENST00000494042 298 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL124P-201ENST00000498656 285 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 NUTF2P2-201ENST00000551207 384 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL049780.1-201ENST00000554430 489 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 APEX1-214ENST00000557054 888 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC092868.1-201ENST00000557949 802 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4642-201ENST00000583943 82 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 TTN-AS1-215ENST00000585451 949 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL137190.1-201ENST00000603288 282 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RNVU1-19-201ENST00000613023 167 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.189-201ENST00000614219 303 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6829-201ENST00000620375 67 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC099667.1-201ENST00000624222 469 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM45A-201ENST00000323523 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00598-208ENST00000617777 2551 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01091-204ENST00000515769 2204 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF101-208ENST00000592502 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RIT2-201ENST00000326695 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP463-201ENST00000363030 120 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 PKMP3-201ENST00000405497 715 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AP001042.1-201ENST00000416842 487 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC011753.4-201ENST00000417974 311 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AL354732.1-204ENST00000421020 755 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1Q9NPL8 AC011747.1-201ENST00000425678 565 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms