Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 CBWD6-203ENST00000456520 1608 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 CDC27-201ENST00000066544 5801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 CASP10-201ENST00000272879 2073 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 CD274-202ENST00000381577 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 ZNF2-204ENST00000617923 3885 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 CCDC191-201ENST00000295878 3976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 HMGB3P1-201ENST00000393368 573 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AL353151.1-201ENST00000402406 604 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 SLC2A11-205ENST00000403208 564 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 RPL21P107-201ENST00000411449 460 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AL109924.2-201ENST00000419800 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 LINC00460-201ENST00000435024 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AL157414.2-201ENST00000442780 377 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 COX4I1P1-201ENST00000554239 509 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AL049780.1-201ENST00000554430 489 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AC087565.1-201ENST00000565061 391 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AC010542.1-201ENST00000568430 555 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 LINC00663-206ENST00000589910 732 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AC138035.1-203ENST00000604354 1066 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AL358335.3-201ENST00000604678 327 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AL133351.5-201ENST00000612789 106 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AL138924.1-201ENST00000629067 415 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 EPB41L5-202ENST00000331393 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 BDNF-206ENST00000395983 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 EFHC1-233ENST00000637353 3829 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 COPS4-201ENST00000264389 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 SPATA31A3-201ENST00000428649 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 SPATA31A5-201ENST00000437823 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AL590065.1-201ENST00000603371 4774 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 YAF2-201ENST00000327791 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 SOX6-210ENST00000528252 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 AC022150.4-201ENST00000598322 2848 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 BMX-203ENST00000357607 2598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
C4orf17Q53FE4 SRPK2-214ENST00000489828 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms