Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
COL24A1Q17RW2 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
COL24A1Q17RW2 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms