Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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CNGB1Q14028 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
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CNGB1Q14028 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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CNGB1Q14028 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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CNGB1Q14028 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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CNGB1Q14028 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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CNGB1Q14028 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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CNGB1Q14028 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
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CNGB1Q14028 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CNGB1Q14028 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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