Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
FOXD4Q12950 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
FOXD4Q12950 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms