Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ACADSBP45954 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms