Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 MYO18A-202ENST00000527372 9992 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 ESR1-208ENST00000443427 6357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 CCDC173-203ENST00000447353 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 MYLK-205ENST00000360772 10027 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 CMKLR1-201ENST00000312143 5283 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 HK2-202ENST00000409174 5278 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 ADGRG5-201ENST00000340339 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 GABRA5-201ENST00000335625 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 TTTY8B-201ENST00000328819 531 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 TTTY8-201ENST00000329684 531 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AL355472.3-201ENST00000425104 410 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC108868.1-201ENST00000431411 554 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 OR6L1P-201ENST00000441446 910 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC119749.1-201ENST00000454884 691 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 PET100-201ENST00000456958 219 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 C3orf67-AS1-201ENST00000463703 562 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AP003551.1-201ENST00000495884 574 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 PGA3-204ENST00000538258 867 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 GSTM3-206ENST00000540225 678 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 PGA4-206ENST00000544899 867 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC009119.1-204ENST00000561599 564 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 SMCR2_1.1-201ENST00000621493 157 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 TEX2-204ENST00000583097 4852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 TEX2-210ENST00000615733 4852 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 GRIA1-203ENST00000448073 2825 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 GALK2-202ENST00000396509 1834 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 PTPRM-203ENST00000400060 5030 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 DCTN1-201ENST00000361874 4500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC005481.1-201ENST00000409610 3456 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 CAB39L-205ENST00000409308 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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HOXD11P31277 HCRTR2-202ENST00000615358 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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HOXD11P31277 C11orf57-202ENST00000393047 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 MEIS2-202ENST00000338564 4829 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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HOXD11P31277 LINC01426-202ENST00000420877 2632 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 DLG3-210ENST00000542398 4529 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 TRPV5-203ENST00000442623 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 RPRD2-202ENST00000369068 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 ADAM21P1-201ENST00000529267 2170 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AMBRA1-202ENST00000458649 5351 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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HOXD11P31277 ADAM10-201ENST00000260408 11431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 KCTD20-204ENST00000449081 4094 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 TUBB-205ENST00000327892 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 MROH7-201ENST00000339553 3459 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 ZNF17-201ENST00000307658 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
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HOXD11P31277 MIR614-201ENST00000385082 90 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC092035.1-201ENST00000418538 390 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
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HOXD11P31277 AL031073.1-201ENST00000503029 1139 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
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HOXD11P31277 AP004245.1-201ENST00000530434 259 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC138907.5-201ENST00000561744 273 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 HP-207ENST00000562526 685 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AC005829.1-202ENST00000562555 298 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
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HOXD11P31277 AC011840.3-201ENST00000579378 280 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
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HOXD11P31277 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 TEX46-203ENST00000622840 479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 POU3F4-201ENST00000373200 3878 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 CACNB4-206ENST00000439467 2159 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 ZNF599-201ENST00000329285 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 AL133492.1-201ENST00000617854 3955 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 ZNF234-204ENST00000592437 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 TMEM161B-205ENST00000506536 2328 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 LINC01915-201ENST00000577994 2321 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 MEG3-220ENST00000522771 6984 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 MAPK10-203ENST00000361569 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HOXD11P31277 ABCC11-204ENST00000394748 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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