Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
PTPRMP28827 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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PTPRMP28827 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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PTPRMP28827 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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PTPRMP28827 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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PTPRMP28827 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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PTPRMP28827 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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PTPRMP28827 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRMP28827 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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