Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 DISP2-201ENST00000267889 12614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 GUCY2F-201ENST00000218006 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 ZKSCAN5-203ENST00000451158 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 AL136529.1-201ENST00000430540 610 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 PTPN14-205ENST00000543945 3842 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 PCDH15-224ENST00000612394 5765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 MSH4-201ENST00000263187 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 CLUHP3-206ENST00000562354 4117 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 NPIPB15-201ENST00000429990 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 LIMCH1-218ENST00000513024 5129 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 RBBP5-201ENST00000264515 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 SYTL4-202ENST00000276141 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 SLC30A8-201ENST00000427715 5430 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC106882.1-201ENST00000515789 2371 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 SOX5-212ENST00000541536 2365 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 TXLNB-201ENST00000358430 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TRHP20396 TMEM161B-201ENST00000296595 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 GTPBP10-202ENST00000257659 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 FAT4-201ENST00000335110 9669 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 MXRA7-207ENST00000592148 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 SULT1C2P1-201ENST00000427208 1875 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 DPH3-202ENST00000383775 3052 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 ESRRG-222ENST00000493748 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 NHLRC3-203ENST00000470258 3298 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 CLRN1-AS1-202ENST00000476886 2223 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 ADGRE3-201ENST00000253673 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC104791.2-201ENST00000623323 2525 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 RPSAP72-201ENST00000407020 358 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 FGF12-AS3-201ENST00000452848 291 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 OR9A3P-202ENST00000485185 878 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC111194.1-201ENST00000509711 422 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC124319.3-201ENST00000616832 526 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC007342.6-201ENST00000624289 2594 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 SMARCA1-202ENST00000371122 4099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 ZSWIM1-202ENST00000372523 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 ZFYVE26-201ENST00000347230 9675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 ZKSCAN3-202ENST00000341464 1794 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 AL079307.1-201ENST00000553312 5982 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 LINC01258-201ENST00000512517 2059 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TRHP20396 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms