Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMOD4Q9NZQ9 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms