Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 VCAN-208ENST00000512590 5923 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
LRRIQ1Q96JM4 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LRRIQ1Q96JM4 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms