Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 HSPD1P4-201ENST00000547203 1702 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
GRIK4Q16099 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms