Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC006019.2-201ENST00000451116 3044 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TRIM28Q13263 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TRIM28Q13263 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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