Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD10P28358 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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HOXD10P28358 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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HOXD10P28358 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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HOXD10P28358 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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HOXD10P28358 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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HOXD10P28358 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD10P28358 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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