Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 OTX2-201ENST00000339475 3001 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 ADAM7-203ENST00000441335 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 MIR1231-201ENST00000408101 92 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 OR5M13P-201ENST00000433944 937 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AL353653.1-202ENST00000435177 539 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC005040.1-201ENST00000437783 482 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC123904.1-201ENST00000441072 368 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 SYNJ2-IT1-201ENST00000442328 599 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC108868.2-201ENST00000451464 511 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 LINC00652-202ENST00000454749 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 PTMAP1-205ENST00000455552 325 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 RPL34P22-201ENST00000468193 318 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC008676.1-202ENST00000520658 545 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC009869.1-201ENST00000530418 528 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC010333.1-201ENST00000563116 563 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 CCL14-202ENST00000618404 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC241377.2-202ENST00000636462 997 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 GMDS-AS1-202ENST00000505870 8217 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 TPD52-204ENST00000517427 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 PCBP1-AS1-230ENST00000439670 2180 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 FNDC3A-206ENST00000541916 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 LINC02367-201ENST00000567749 4388 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 NLRP3-203ENST00000366496 3996 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 SUPT7L-201ENST00000337768 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP236-201ENST00000410635 284 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 RPL29P7-201ENST00000440227 457 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL647P-201ENST00000485429 300 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 IGHV1OR15-3-201ENST00000564926 351 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 MIR5705-201ENST00000579870 89 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TRIM35Q9UPQ4 AC012065.3-201ENST00000602736 439 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
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