Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SAMD8Q96LT4 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SAMD8Q96LT4 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms