Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TENM2-207ENST00000520394 8034 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL031595.3-201ENST00000624919 14262 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TMEM178B-202ENST00000565468 10558 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TMEM178B-203ENST00000610315 10552 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZBTB40-204ENST00000404138 8992 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MAST4-201ENST00000261569 7664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC1Q15751 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms