Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 TTN-AS1-265ENST00000627661 806 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 GJC1-201ENST00000330514 3295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ZHX3-218ENST00000560364 4283 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC073525.1-203ENST00000547040 2631 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 PTBP3-203ENST00000343327 2755 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 LINC01105-204ENST00000444416 2695 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 TMEM169-201ENST00000295658 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CD44-208ENST00000428726 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CACNA1D-219ENST00000636938 6868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 NCAPH-201ENST00000240423 2763 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ZKSCAN5-201ENST00000326775 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 NF1P2-201ENST00000556855 2505 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RGS8-203ENST00000367557 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 GAS8-AS1-201ENST00000408886 435 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL136454.1-201ENST00000443181 466 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 GTF2F2P2-201ENST00000445825 721 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC113352.1-201ENST00000513196 666 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 BCL2L11-224ENST00000639340 243 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC000099.1-202ENST00000413812 1912 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 HKR1-203ENST00000541583 2758 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 PARP9-202ENST00000462315 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 NUP37-209ENST00000552283 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SELENOP-203ENST00000506577 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SLC30A8-208ENST00000521243 1393 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL357055.3-201ENST00000421157 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 KCNJ15-221ENST00000613499 3049 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ZNF225-206ENST00000592780 2538 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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