Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CENPFP49454 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 OR2M4-202ENST00000641868 5934 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 GIGYF2-205ENST00000409547 5978 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 TAF1-201ENST00000276072 5692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CENPFP49454 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 SCUBE3-201ENST00000274938 7356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 COL6A5-201ENST00000265379 9214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CENPFP49454 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.9 ms