Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
PDGFDQ9GZP0 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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