Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 UBR1-202ENST00000546274 3332 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AMBN-203ENST00000613447 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 LMO3-204ENST00000354662 3574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AL031594.1-201ENST00000417123 1932 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 WDR19-207ENST00000506503 2513 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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