Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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C10orf55Q5SWW7 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 SUPT4H1-207ENST00000581540 668 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
C10orf55Q5SWW7 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
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