Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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CCDC93Q567U6 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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CCDC93Q567U6 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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CCDC93Q567U6 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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CCDC93Q567U6 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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CCDC93Q567U6 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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CCDC93Q567U6 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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CCDC93Q567U6 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CCDC93Q567U6 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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