Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TTPAP49638 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TTPAP49638 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TTPAP49638 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TTPAP49638 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TTPAP49638 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TTPAP49638 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TTPAP49638 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TTPAP49638 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TTPAP49638 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TTPAP49638 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TTPAP49638 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TTPAP49638 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TTPAP49638 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TTPAP49638 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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TTPAP49638 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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TTPAP49638 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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TTPAP49638 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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TTPAP49638 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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TTPAP49638 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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TTPAP49638 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TTPAP49638 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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TTPAP49638 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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TTPAP49638 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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TTPAP49638 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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TTPAP49638 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TTPAP49638 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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