Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PRKCHP24723 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms