Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
V9GYQ6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
V9GYQ6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V9GYQ6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
V9GYQ6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
V9GYQ6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
V9GYQ6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
V9GYQ6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
V9GYQ6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
V9GYQ6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
V9GYQ6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
V9GYQ6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
V9GYQ6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
V9GYQ6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
V9GYQ6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
V9GYQ6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
V9GYQ6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
V9GYQ6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
V9GYQ6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
V9GYQ6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
V9GYQ6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
V9GYQ6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
V9GYQ6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
V9GYQ6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms