Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
SNX8Q9Y5X2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX8Q9Y5X2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms