Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NRXN3Q9Y4C0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NRXN3Q9Y4C0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms