Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNSTRNQ9Y448 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KNSTRNQ9Y448 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms