Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
R3HCC1Q9Y3T6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
R3HCC1Q9Y3T6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms