Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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SH3BP1Q9Y3L3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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SH3BP1Q9Y3L3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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SH3BP1Q9Y3L3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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SH3BP1Q9Y3L3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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SH3BP1Q9Y3L3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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SH3BP1Q9Y3L3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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SH3BP1Q9Y3L3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1Q9Y3L3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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