Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP11Q9Y3A2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms