Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
THRAP3Q9Y2W1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THRAP3Q9Y2W1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms