Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATF5Q9Y2D1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF5Q9Y2D1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF5Q9Y2D1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF5Q9Y2D1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF5Q9Y2D1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF5Q9Y2D1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF5Q9Y2D1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF5Q9Y2D1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF5Q9Y2D1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF5Q9Y2D1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF5Q9Y2D1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms