Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC4Q9Y296 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC4Q9Y296 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms