Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGSF9BQ9UPX0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms